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sábado, 18 de fevereiro de 2012

Sequenciamento genético expresso

TRANSCRITO DE:http://detudoblogue.blogspot.com/2012/02/sequenciamento-genetico-expresso.html



Sequenciamento genético expresso

 
 
A MinION, uma minúscula máquina de sequenciamento de DNA.
 
Uma empresa britânica inventou uma máquina de sequenciamento de DNA praticamente do tamanho de um pendrive, que deverá revolucionar o setor.

A empresa Oxford Nanopore acaba de apresentar duas máquinas de nova geração capazes de realizar o mesmo trabalho dos atuais dispositivos de grande porte, decodificando os blocos constituites de vida em horas, em vez de dias.

A tecnologia poderá ser usada em campo, para realizar exames no local e sequenciar doenças causadas por micro-organismos de mutação rápida, como  HIV e malária para estabelecer formas de tratamento, além de varredura pré-natal para descobrir eventuais anomalias genéticas, e até para procurar mutações genéticas em plantas. Há expectativas de surgir interesse pela tecnologia por firmas do setor agricola, como BASF e Monsanto.

Os dispositivos se baseiam no "sequenciamento segmentado" de DNA, e poderão ser lançados no segundo semestre deste ano.

Uma das máquinas, chamada "GridION", tem o tamanho semelhante ao de um tocador de DVD. Várias unidades podem ser empilhadas e conectadas umas às outras para aumentar a velocidade de processamento. O outro sequenciador, chamado "MinION", que deverá custar menos de US$900 - é quase do tamanho de um pendrive.


A singular tecnologia do sequenciamento nanopore levou quase duas décadas para chegar ao atual estágio; uma verdadeira técnica de análise de moléculas anômalas individuais , desenvolvida simultaneamente com novos dispositivos eletrônicos para compor um sistema universal de sequenciamento. A GridION e a MinION devem trazer inúmeros benefícios aos pesquisadores e clínicos."


Os atuais máquinas de sequenciamento de DNA, fabricadas pela Illumina e Life Technologies, ambas da Califórnia, são muito maiores e bem mais lentas. A Life Tech está recebendo encomendas de máquinas de grande porte ao custo de US$ 149.000, que realizam a transcrição do DNA humano por cerca de US$1.000. Há cinco anos, o custo de cada sequenciamento de DNA humano era US$10 milhões.


A empresa Oxford Nanopore diz que sua tecnologia permitirá fazer o trabalho em algumas horas - vírus poderão ser decifrados em segundos - e é realmente revolucionária. A importância da introdução desta tecnologia é comparável à susbtituição dos grandes computadores pelos laptops.


A tecnologia de sequenciamento segmentado é considerado superior à do sequenciamento de exonuclease, mais antiga, porque a leitura do DNA é feita diretamente. No sequenciameento segmentado, um trecho inteiro de DNA passa intacto através de um pequeno orifício criado por uma proteína oriunda de engenharia genética, ou nanoporo, em uma membrana celular. É como sugar espaguete rapidamente. No sequenciamento de exonuclease, os blocos que formam o DNA são separados por uma enzima e passam pelo orifício todos ao mesmo tempo.


A maior dificuladade foi desacelerar o processo, do ritmo de 1 milhão de sequências de bases de DNA por segundo para 300 bases por segundo, de forma que o DNA possa ser lido, resolvendo o problema da necessidade de leitura de várias bases.

Mais detalhes (em inglês):

http://www.nanoporetech.com/

http://www.illumina.com/

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